ゲノム日記 Genome Diary

ゲノム解析についてのメモランダム

2023-01-01から1年間の記事一覧

インスリンとレセプターの受容シミュレーション

前回の記事の続き。インスリンとレセプターの間の受容をシミュレーションするサンプルコードを生成してみます。 Q:ヒトインスリンとそのレセプターとの間での接続を分子動力学を持ってシミュレーションしたいと思います。サンプルとなるpythonコードを提示し…

インスリン受容の阻害要因について調査 / Investigating inhibitory factors in insulin reception

インスリンの挙動をコンピュータでシミュレーションすることができれば、有機化学的証明をフィールド実験無しで実践することができた事になる。少なくとも生体実験を不要にするための第一歩になる。 インスリンとその受容体(レセプター)との間に何らかの阻害…

分子動力学へのAIの適応とタンパク質の解析への応用

以下、サマリ(ChatGPT生成) 分子動力学へのAIの適応について議論しました。AIを利用することで、計算コストを削減し、シミュレーション速度を向上させる可能性があることを指摘しました。しかし、いくつかの注意点があり、機械学習モデルの精度、訓練データ…

タンパク質の物理的構造のシミュレーションについて

生体の物理的構造を理解することが重要なので、まずは基礎となるタンパク質の物理的特性をコンピュータでシミュレーションすることを考える。 Q:タンパク質の中で、最も単純な構造を持つものを教えて下さい。 A: タンパク質はアミノ酸がポリペプチド鎖を形成…

組織工学について

組織工学について概要や事例をChatGPTに聞いたもの。 多面的な学問を総合することで実現し、様々な応用範囲があるが、Scaffoldの選択、血管網の生成、免疫応答の管理、実用化パイプラインの構築において課題が存在するとのこと。 組織工学(tissue engineeri…

この日記について

ChatGPTが出て、様々な分野の深いレベルの知識をカジュアルに得ることができるようになりましたので、以前から興味があったゲノム解析について調査をし、その情報をこの日記に書きます。従い、前提として私はゲノム解析についてど素人です。 Disclaimer Chat…